Харутора Цутимикадо происходит из семьи оммёдзи, но не обладает способностью видеть духов. Он учится в Академии оммё вместе с друзьями, ведя обычную студенческую жизнь. Его подруга детства Нацумэ, являющаяся наследницей главы семьи, нарушает этот уклад своим внезапным появлением. Событие вносит изменения в повседневное существование Харуторы. Дальнейшее развитие сюжета связано с влиянием Нацумэ на жизнь главного героя. Отношения между персонажами и их общее прошлое становятся основой для
Сакамичи Онода поступил в старшую школу и намеревался вступить в аниме-клуб. В средней школе у него не было знакомых, с которыми можно было обсуждать аниме, игры и Акихабару. При поступлении выяснилось, что аниме-клуб расформирован. Для его восстановления Оноде требовалось найти четырех других учеников. Онода использует велосипед типа «мамачари» для поездок за продуктами и еженедельных посещений Акихабары. Велосипедист-гонщик Шунскэ Имаизуми заметил Оноду во время подъема на крутой дороге.
Кайто Даймон и его друзья отправляются в Англию с целью восстановить память Дзина Макаты. Они спускаются в подземный лабиринт под церковью, где в детстве Кайто и Рук Бандзё Кроссфилд впервые встретили Дзина. В лабиринте перед ними появляется незнакомая девушка. Дзин называет её Раэтсель, что указывает на их предыдущее знакомство. Внезапно девушка исчезает вместе с Дзином. Одновременно в подземном лабиринте активируются ловушки. Эти события становятся отправной точкой для нового этапа
Кото вместе с двумя фамильярами, А и Ун, оказывается в незнакомом городе. Персонажи заняты поисками чёрного кролика, который, предположительно, необходим для возвращения домой. Эти поиски систематически приводят к масштабным разрушениям и беспорядкам в населённом пункте под названием Киото. Данное место населено ёкаями и не имеет отношения к реальному городу с таким же названием. Кото занимает позицию старшей среди трёх персонажей. В процессе повествования выявляется, что между ней и этим Киото
В 2039 году повышение уровня моря, вызванное глобальным потеплением, привело к значительной потере суши. В ответ на это появился флот мощных боевых кораблей с передовым вооружением, который нанес сокрушительное поражение военно-морским силам по всему миру. Этот флот, назвавший себя «Туман», использует «Ментальные Модели» — человекоподобные аватары, представляющие сердце корабля, его «Союзное Ядро». Каждая модель обладает уникальной личностью, но все подчиняются неизвестной власти, известной как
Мотоко Кусанаги завершила работу с 501-м секретным отделом и теперь подчиняется приказам Дайсукэ Арамаки. Неизвестный взломал искусственный интеллект Логикомы. Бато начинает собирать команду для расследования. Он получает поддержку бывшего офицера армейской разведки Исикавы и специалиста по взрывчатке Бомы. Кусанаги также намерена привлечь к операции снайпера Сайто и тайного агента Падзу. Девятый отдел приступает к новой операции. Участники группы обладают различными профессиональными навыками,
Комори Юи обладает способностью видеть духов, что создает для нее определенные трудности. Из-за перевода отца на новое место работы ей приходится сменить школу. Она оказывается в учебном заведении, где обучаются дети из богатых и знаменитых семей. В этой школе установлены нестандартные правила — занятия начинаются поздно вечером. Среди учащихся ходят слухи о присутствии вампиров. Юи сталкивается с шестью братьями Сакамаки, которые, по-видимому, являются вампирами и проявляют садистские
Персонаж Мирай Курияма является последней выжившей из клана воинов Мира Духов, способных использовать собственную кровь в качестве оружия. Её задача — охота и уничтожение «юму», существ, представляющих собой проявление негативных человеческих эмоций. На школьной крыше Мирай встречает Акихто Канбара — редкого полукровку юму в человеческой форме. В состоянии паники она пронзает его кровавым клинком, но обнаруживает, что он бессмертен. Между ними возникает импровизированная дружба, основанная на