Яблочное зёрнышко: Проект «Альфа»

Действие разворачивается в альтернативной временной линии, не связанной с предыдущими фильмами серии "Appleseed". Бриареос изначально является киборгом, а не становится им в ходе сюжета. Деунан и Бриареос не разлучаются и не воссоединяются в Олимпе для вступления в ESWAT. События происходят в XXII веке и охватывают ранний период их совместной жизни. Персонажи путешествуют по разрушенному Нью-Йорку в поисках города Олимп.

В руинах Деунан и Бриареос нанимаются к местному военачальнику по прозвищу Два Рога для уничтожения двуногих боевых машин. Во время боя они встречают Ирис и Олсона, выполняющих собственное задание. Персонажи объединяются и присоединяются к миссии новых знакомых. Ирис должна помешать киборгу Талосу захватить секретное оружие, которое создавали люди. Талос использует Ирис для активации гигантской боевой машины.