Главный герой Микадо Рюгаминэ переезжает в район Икэбукуро по приглашению друга детства Масаоми Киды. В этом районе Токио действуют уличные банды, фармацевтические компании занимаются незаконной деятельностью, а среди местных жителей ходят легенды о безголовом мотоциклисте на черном байке. Микадо предстоит привыкнуть к жизни в большом городе после размеренной сельской обстановки. В новой среде Микадо знакомится с различными аспектами городской жизни: он вступает в контакт с участниками сетевых

Сюжет разворачивается в Токио 2039 года, спустя десять лет после пандемии вируса, известного как «Апокалипсис». В этот период власть сосредоточена в руках мультинациональной организации GHQ, которая занимается экспериментами в области генной инженерии. Главный герой — Сю Ома, старшеклассник, испытывающий трудности в общении с окружающими. Он стремится завести друзей и преодолеть свою замкнутость. Сю встречает девушку по имени Инори, которая является участницей группы сопротивления «Гробовщики».