Космический линкор Ямато

В 2199 году Земля подвергается нападению Империи Гамилус под руководством Лорда Деслера. Инопланетная раса использует радиоактивные астероиды для бомбардировки поверхности планеты, делая её непригодной для жизни. Человечество вынуждено укрыться в подземных городах, но радиация постепенно проникает и туда.

На Марсе терпит крушение инопланетный корабль. Сусуму Кодай и Дайсукэ Сима находят на борту тело девушки и послание от правительницы планеты Искандер Старси. Она предлагает землянам устройство для очистки поверхности от радиации и прилагает инструкцию по созданию мощного двигателя. Главные герои находят затонувший во время Второй Мировой войны корабль "Ямато", модифицируют его и отправляются к Искандеру под командованием капитана Дзюдзо Окиты. Экипажу необходимо завершить путешествие за один год, иначе человечество погибнет.