Детектив Конан: На перекрёстках древней столицы

Маскированный самурай в течение одной ночи убивает пятерых мужчин в разных городах Японии: троих в Токио, одного в Осака и одного в Киото. Полиция выясняет, что все жертвы были членами банды Гэндзиботару, специализировавшейся на краже буддийских статуй и артефактов. Члены банды использовали псевдонимы, основанные на именах слуг Минамото-но Ёсицунэ. Расследование заходит в тупик из-за отсутствия явных мотивов и улик для опознания остальных участников банды.

В храм Киото поступает анонимное письмо с необычной головоломкой. Монахи обращаются за помощью к известному детективу Когоро Мори, чтобы расшифровать послание и найти давно утерянную статую. Синъити Кудо в образе Конана Эдогавы объединяется с детективом из Осака Хэйдзи Хаттори для решения загадки и поиска убийцы. Одновременно Хаттори разыскивает свою подругу детства. Используя знание Хаттори Киото, они исследуют город и постепенно раскрывают правду. Убийца совершает новое нападение на члена банды и после нескольких попыток покушения на Хаттори похищает его возлюбленную. Конан и Хаттори должны совместными усилиями найти скрытые улики, чтобы остановить убийцу и спасти девушку.