Записная книжка Бога

Главный герой, Наруми Фудзисима, учится в школе и держится обособленно от одноклассников из-за частых переездов и отсутствия интереса к общению. После очередного переезда он знакомится с одноклассницей Аякой Синодзаки. Она предлагает ему вступить в кружок садоводства и приглашает отметить это событие на своей работе. Там Наруми встречает нанимательницу Аяки — девочку по имени Алиса, примерно десяти-двенадцати лет.

Алиса почти не встает с кровати и проводит время в окружении плюшевых игрушек и мониторов. Она занимается расследованием тайн и решением проблем, возникающих в городе. Сюжет строится вокруг того, как Наруми постепенно вовлекается в деятельность Алисы и сталкивается с различными загадочными событиями, которые ей предстоит разгадать.