Безграничный Фафнир

В мире появились существа, названные драконами, что привело к значительным изменениям в обществе. Вскоре после этого начали рождаться девушки, обладающие способностью управлять драконами. Эта способность получила название «Д». Для обучения таких девушек была создана женская академия Мидгар.

Главный герой Ю Мононобэ является единственным известным парнем, обладающим «Д». Его существование и способности держатся в секрете. В первый день в академии он случайно сталкивается с ученицей по имени Ирис в неловкой ситуации. Позже он узнает, что в академии учится его младшая сестра Мицуки, с которой они были разлучены в детстве.