Девичьи воздушные силы

В небе над планетой появляются неопознанные летательные аппараты, получившие название «Дзай». Эти машины способны уничтожать воздушные силы любого государства. В ответ на угрозу страны начинают разработку специального оружия — «Дочерей». Эти боевые единицы управляются автоматическими механизмами пилотирования «анима», которые имеют внешность обычных девушек. На протяжении нескольких лет Дзай продолжают атаковать военные объекты в Восточной Азии.

Главный герой истории, Кэй Нарутани, возвращается в Японию на флоте. Вблизи китайского города Шанхай корабль подвергается нападению Дзай. Во время эвакуации на спасательной шлюпке Кэй замечает красный истребитель, который поражает вражеский аппарат. Однако сам истребитель получает повреждения и падает в море. Кэй решает оказать помощь и направляется к месту крушения. Вместо ожидаемого пилота он обнаруживает маленькую девочку по имени Грипен. Выясняется, что она является ключевым элементом в противостоянии Дзай и последней надеждой человечества.